中国全科医学 ›› 2024, Vol. 27 ›› Issue (08): 961-970.DOI: 10.12114/j.issn.1007-9572.2023.0360
所属专题: 内分泌代谢性疾病最新文章合辑; 泌尿系统疾病最新文章合辑; 肾脏疾病最新文章合辑
邹琼1,2, 吴曦1, 张杨1, 万毅3, 陈长生1,*(
)
收稿日期:2023-06-20
修回日期:2023-09-05
出版日期:2024-03-15
发布日期:2023-12-19
通讯作者:
陈长生
基金资助:
ZOU Qiong1,2, WU Xi1, ZHANG Yang1, WAN Yi3, CHEN Changsheng1,*(
)
Received:2023-06-20
Revised:2023-09-05
Published:2024-03-15
Online:2023-12-19
Contact:
CHEN Changsheng
摘要: 背景 糖尿病肾病(DN)是糖尿病常见的微血管并发症之一,发病率高,危害性大。早期发现DN对预防相关疾病非常重要。目前大多研究基于传统的统计预测方法,数据需满足其所要求的前提假设条件。近年来已无法很好满足其在DN预测领域的需求,有必要尝试开展机器学习等新方法在DN预测领域的应用。 目的 利用LASSO回归和麻雀搜索算法(SSA)优化的BP神经网络(SSA-BP神经网络)构建DN预测模型。 方法 本研究时间为2023年4—8月,数据来源于公开的伊朗133例糖尿病患者的并发症数据。采用SPSS 26.0软件进行单因素分析,采用LASSO回归筛选变量。以是否患DN为因变量,分别用8∶2和7∶3的比例划分训练集和测试集,使用SSA-BP神经网络进行建模与分析,并与经典的机器学习模型对比预测性能以分析较优的DN模型。基于准确率、精确率、灵敏度、特异度、F1-score和受试者工作特征曲线下面积(AUC)指标进行模型评价。 结果 剔除9例1型糖尿病患者,本研究纳入的有效样本量为124例2型糖尿病(T2DM)患者,其中73例(58.9%)被诊断为DN患者。单因素分析显示年龄、BMI、糖尿病持续时间、空腹血糖(FBG)、糖化血红蛋白(HbA1c)、低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、三酰甘油(TG)、收缩压(SBP)和舒张压(DBP)的T2DM患者DN危险因素(P<0.05)。训练集∶测试集=8∶2时,训练集(n=100)中有59例DN患者,测试集(n=24)含有14例DN患者。LASSO回归筛选出年龄、糖尿病持续时间、HbA1c、LDL和SBP共5个影响因素。Logistic回归(LR)、K近邻(KNN)、支持向量机(SVM)、BP神经网络、SSA-BP神经网络模型在测试集的准确率分别为83.33%、79.17%、79.17%、87.50%、95.83%。F1-score分别为0.846 2、0.800 0、0.800 0、0.888 9、0.960 0。训练集∶测试集=7∶3时,训练集(n=88)中有52例DN患者,测试集(n=36)含有21例DN患者。LASSO回归筛选出年龄、BMI、糖尿病持续时间、LDL、HDL、SBP和DBP这7个影响因素。LR、KNN、SVM、BP神经网络、SSA-BP神经网络模型在测试集的准确率分别为86.11%、86.11%、86.11%、72.22%、91.67%。F1-score分别为0.871 8、0.871 8、0.864 9、0.705 9、0.909 1。 结论 LR、KNN和SVM模型在训练集∶测试集=7∶3时性能较好,BP神经网络和SSA-BP神经网络模型在训练集∶测试集=8∶2时性能较好。相较于BP神经网络模型和传统机器学习模型,SSA-BP神经网络模型的预测性能更佳,可及时准确识别T2DM DN患者,实现DN的早发现和早治疗,从而预防并减缓对其身体带来的危害。
| 编号 | 变量名 | 赋值情况及值范围 |
|---|---|---|
| 1 | 肾病 | 否=0(对照),是=1 |
| 2 | 性别 | 女=0(对照),男=1 |
| 3 | 年龄(岁) | <40=1(对照),40~<60=2,≥60=3 |
| 4 | BMI(kg/m2) | <18.5=1(对照),18.5~<24.0=2,24.0~<28.0=3,≥28.0=4 |
| 5 | 糖尿病持续时间(年) | <10=0(对照),≥10=1 |
| 6 | FBG(mg/dL) | 实测值:80~510 |
| 7 | HbA1c(mg/dL) | 实测值:6.5~13.3 |
| 8 | LDL(mg/dL) | 实测值:36~267 |
| 9 | HDL(mg/dL) | 实测值:20~62 |
| 10 | TG(mg/dL) | 实测值:74~756 |
| 11 | 治疗类型 | 口服剂=1(对照),胰岛素=2,二者=3 |
| 12 | 他汀类药物类型 | 无他汀类药物=1(对照),阿托伐他汀=2,瑞舒伐他汀=3 |
| 13 | SBP(mmHg) | 实测值:105~180 |
| 14 | DBP(mmHg) | 实测值:60~120 |
表1 变量赋值说明
Table 1 The description of variable assignment
| 编号 | 变量名 | 赋值情况及值范围 |
|---|---|---|
| 1 | 肾病 | 否=0(对照),是=1 |
| 2 | 性别 | 女=0(对照),男=1 |
| 3 | 年龄(岁) | <40=1(对照),40~<60=2,≥60=3 |
| 4 | BMI(kg/m2) | <18.5=1(对照),18.5~<24.0=2,24.0~<28.0=3,≥28.0=4 |
| 5 | 糖尿病持续时间(年) | <10=0(对照),≥10=1 |
| 6 | FBG(mg/dL) | 实测值:80~510 |
| 7 | HbA1c(mg/dL) | 实测值:6.5~13.3 |
| 8 | LDL(mg/dL) | 实测值:36~267 |
| 9 | HDL(mg/dL) | 实测值:20~62 |
| 10 | TG(mg/dL) | 实测值:74~756 |
| 11 | 治疗类型 | 口服剂=1(对照),胰岛素=2,二者=3 |
| 12 | 他汀类药物类型 | 无他汀类药物=1(对照),阿托伐他汀=2,瑞舒伐他汀=3 |
| 13 | SBP(mmHg) | 实测值:105~180 |
| 14 | DBP(mmHg) | 实测值:60~120 |
| 变量 | 无DN (n=51) | 患DN (n=73) | 检验统计量值 | P值 |
|---|---|---|---|---|
| 性别[例(%)] | 1.759a | 0.185 | ||
| 女 | 34(66.7) | 40(54.8) | ||
| 男 | 17(33.3) | 33(45.2) | ||
| 年龄[例(%)] | 19.229a | <0.001 | ||
| <40岁 | 5(9.8) | 4(5.5) | ||
| 40~<60岁 | 37(72.5) | 28(38.4) | ||
| ≥60岁 | 9(17.7) | 41(56.1) | ||
| BMI[例(%)] | 13.100a | 0.002 | ||
| <18.5 kg/m2 | 2(3.9) | 0 | ||
| 18.5 ~<24.0 kg/m2 | 10(19.6) | 2(2.7) | ||
| 24.0~<28.0 kg/m2 | 9(17.6) | 12(16.4) | ||
| ≥28.0 kg/m2 | 30(58.9) | 59(80.9) | ||
| 糖尿病持续时间[例(%)] | 27.358a | <0.001 | ||
| <10年 | 39(76.5) | 21(28.8) | ||
| ≥10年 | 12(23.5) | 52(71.2) | ||
| FBG( | 181.33±65.97 | 229.03±54.84 | -4.381b | <0.001 |
| HbA1c[M(QR),%] | 8.10(1.60) | 10.80(0.95) | -5.773c | <0.001 |
| LDL( | 109.12±35.17 | 152.68±42.67 | -6.003b | <0.001 |
| HDL( | 38.55±8.43 | 35.74±5.84 | 2.193b | 0.030 |
| TG( | 181.96±84.95 | 242.04±102.79 | -3.433b | 0.001 |
| 治疗类型[例(%)] | 4.281a | 0.113 | ||
| 口服剂 | 35(68.6) | 38(52.1) | ||
| 胰岛素 | 4(7.8) | 14(19.2) | ||
| 二者 | 12(23.6) | 21(28.7) | ||
| 他汀类药物类型[例(%)] | 0.814a | 0.778 | ||
| 无他汀类药物 | 16(31.3) | 19(26.0) | ||
| 阿托伐他汀 | 34(66.7) | 53(72.6) | ||
| 瑞舒伐他汀 | 1(2.0) | 1(1.4) | ||
| SBP( | 130±15 | 155±14 | -9.524b | <0.001 |
| DBP( | 81±9 | 98±12 | -8.499b | <0.001 |
表2 2型糖尿病肾病患者相关危险因素的单因素分析
Table 2 Univariate analysis of risk factors associated with type 2 diabetic nephropathy
| 变量 | 无DN (n=51) | 患DN (n=73) | 检验统计量值 | P值 |
|---|---|---|---|---|
| 性别[例(%)] | 1.759a | 0.185 | ||
| 女 | 34(66.7) | 40(54.8) | ||
| 男 | 17(33.3) | 33(45.2) | ||
| 年龄[例(%)] | 19.229a | <0.001 | ||
| <40岁 | 5(9.8) | 4(5.5) | ||
| 40~<60岁 | 37(72.5) | 28(38.4) | ||
| ≥60岁 | 9(17.7) | 41(56.1) | ||
| BMI[例(%)] | 13.100a | 0.002 | ||
| <18.5 kg/m2 | 2(3.9) | 0 | ||
| 18.5 ~<24.0 kg/m2 | 10(19.6) | 2(2.7) | ||
| 24.0~<28.0 kg/m2 | 9(17.6) | 12(16.4) | ||
| ≥28.0 kg/m2 | 30(58.9) | 59(80.9) | ||
| 糖尿病持续时间[例(%)] | 27.358a | <0.001 | ||
| <10年 | 39(76.5) | 21(28.8) | ||
| ≥10年 | 12(23.5) | 52(71.2) | ||
| FBG( | 181.33±65.97 | 229.03±54.84 | -4.381b | <0.001 |
| HbA1c[M(QR),%] | 8.10(1.60) | 10.80(0.95) | -5.773c | <0.001 |
| LDL( | 109.12±35.17 | 152.68±42.67 | -6.003b | <0.001 |
| HDL( | 38.55±8.43 | 35.74±5.84 | 2.193b | 0.030 |
| TG( | 181.96±84.95 | 242.04±102.79 | -3.433b | 0.001 |
| 治疗类型[例(%)] | 4.281a | 0.113 | ||
| 口服剂 | 35(68.6) | 38(52.1) | ||
| 胰岛素 | 4(7.8) | 14(19.2) | ||
| 二者 | 12(23.6) | 21(28.7) | ||
| 他汀类药物类型[例(%)] | 0.814a | 0.778 | ||
| 无他汀类药物 | 16(31.3) | 19(26.0) | ||
| 阿托伐他汀 | 34(66.7) | 53(72.6) | ||
| 瑞舒伐他汀 | 1(2.0) | 1(1.4) | ||
| SBP( | 130±15 | 155±14 | -9.524b | <0.001 |
| DBP( | 81±9 | 98±12 | -8.499b | <0.001 |
图2 LASSO回归变量筛选注:A、B表示训练集∶测试集=8∶2时,13个变量的系数曲线和10倍交叉验证的LASSO回归选择最佳的变量;C、D表示训练集:测试集=7∶3时,13个变量的系数曲线和10倍交叉验证的LASSO回归选择最佳的变量
Figure 2 LASSO regression screening for variables
| 模型类型 | 准确率(%) | 精确率(%) | 灵敏度(%) | 特异度(%) | F1-score | AUC | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 训练集∶测试集=8∶2 | LR | 训练集 | 89.00 | 90.00 | 91.53 | 85.37 | 0.907 6 | 0.884 5 |
| 测试集 | 83.33 | 91.67 | 78.57 | 90.00 | 0.846 2 | 0.842 9 | ||
| KNN | 训练集 | 91.00 | 94.64 | 89.83 | 92.68 | 0.921 7 | 0.912 6 | |
| 测试集 | 79.17 | 90.91 | 71.43 | 90.00 | 0.800 0 | 0.807 1 | ||
| SVM | 训练集 | 91.00 | 94.64 | 89.83 | 92.68 | 0.921 7 | 0.912 6 | |
| 测试集 | 79.17 | 90.91 | 71.43 | 90.00 | 0.800 0 | 0.807 1 | ||
| BP神经网络 | 训练集 | 86.00 | 84.85 | 93.33 | 75.00 | 0.888 9 | 0.841 7 | |
| 测试集 | 87.50 | 85.71 | 92.31 | 81.82 | 0.888 9 | 0.870 6 | ||
| SSA-BP神经网络 | 训练集 | 92.00 | 94.83 | 91.67 | 92.50 | 0.932 2 | 0.920 8 | |
| 测试集 | 95.83 | 100.00 | 92.31 | 100.00 | 0.960 0 | 0.961 5 | ||
| 训练集∶测试集=7∶3 | LR | 训练集 | 87.50 | 90.20 | 88.46 | 86.11 | 0.893 2 | 0.873 0 |
| 测试集 | 86.11 | 94.44 | 80.95 | 93.33 | 0.871 8 | 0.871 0 | ||
| KNN | 训练集 | 94.32 | 97.96 | 92.31 | 97.22 | 0.950 5 | 0.948 0 | |
| 测试集 | 86.11 | 94.44 | 80.95 | 93.33 | 0.871 8 | 0.871 0 | ||
| SVM | 训练集 | 89.77 | 97.78 | 84.62 | 97.22 | 0.907 2 | 0.909 0 | |
| 测试集 | 86.11 | 100.00 | 76.19 | 100.00 | 0.864 9 | 0.881 0 | ||
| BP神经网络 | 训练集 | 85.23 | 92.00 | 83.64 | 87.88 | 0.8762 1 | 0.857 6 | |
| 测试集 | 72.22 | 75.00 | 66.67 | 77.78 | 0.705 9 | 0.722 2 | ||
| SSA-BP神经网络 | 训练集 | 94.32 | 94.64 | 96.36 | 90.91 | 0.955 0 | 0.936 4 | |
| 测试集 | 91.67 | 100.00 | 83.33 | 100.00 | 0.909 1 | 0.916 7 |
表3 机器学习模型在不同样本拆分比例下预测DN的准确率、精确率、灵敏度、特异度、F1-score和AUC
Table 3 Accuracy,precision,sensitivity,specificity,F1-score and AUC of machine learning models in predicting DN under varied sample splitting ratios
| 模型类型 | 准确率(%) | 精确率(%) | 灵敏度(%) | 特异度(%) | F1-score | AUC | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 训练集∶测试集=8∶2 | LR | 训练集 | 89.00 | 90.00 | 91.53 | 85.37 | 0.907 6 | 0.884 5 |
| 测试集 | 83.33 | 91.67 | 78.57 | 90.00 | 0.846 2 | 0.842 9 | ||
| KNN | 训练集 | 91.00 | 94.64 | 89.83 | 92.68 | 0.921 7 | 0.912 6 | |
| 测试集 | 79.17 | 90.91 | 71.43 | 90.00 | 0.800 0 | 0.807 1 | ||
| SVM | 训练集 | 91.00 | 94.64 | 89.83 | 92.68 | 0.921 7 | 0.912 6 | |
| 测试集 | 79.17 | 90.91 | 71.43 | 90.00 | 0.800 0 | 0.807 1 | ||
| BP神经网络 | 训练集 | 86.00 | 84.85 | 93.33 | 75.00 | 0.888 9 | 0.841 7 | |
| 测试集 | 87.50 | 85.71 | 92.31 | 81.82 | 0.888 9 | 0.870 6 | ||
| SSA-BP神经网络 | 训练集 | 92.00 | 94.83 | 91.67 | 92.50 | 0.932 2 | 0.920 8 | |
| 测试集 | 95.83 | 100.00 | 92.31 | 100.00 | 0.960 0 | 0.961 5 | ||
| 训练集∶测试集=7∶3 | LR | 训练集 | 87.50 | 90.20 | 88.46 | 86.11 | 0.893 2 | 0.873 0 |
| 测试集 | 86.11 | 94.44 | 80.95 | 93.33 | 0.871 8 | 0.871 0 | ||
| KNN | 训练集 | 94.32 | 97.96 | 92.31 | 97.22 | 0.950 5 | 0.948 0 | |
| 测试集 | 86.11 | 94.44 | 80.95 | 93.33 | 0.871 8 | 0.871 0 | ||
| SVM | 训练集 | 89.77 | 97.78 | 84.62 | 97.22 | 0.907 2 | 0.909 0 | |
| 测试集 | 86.11 | 100.00 | 76.19 | 100.00 | 0.864 9 | 0.881 0 | ||
| BP神经网络 | 训练集 | 85.23 | 92.00 | 83.64 | 87.88 | 0.8762 1 | 0.857 6 | |
| 测试集 | 72.22 | 75.00 | 66.67 | 77.78 | 0.705 9 | 0.722 2 | ||
| SSA-BP神经网络 | 训练集 | 94.32 | 94.64 | 96.36 | 90.91 | 0.955 0 | 0.936 4 | |
| 测试集 | 91.67 | 100.00 | 83.33 | 100.00 | 0.909 1 | 0.916 7 |
图4 BP神经网络优化前后的预测值和真实值误差对比图注:A为训练集:测试集=8∶2;B为训练集∶测试集=7∶3。
Figure 4 Comparison of predicted and observed value errors before and after BP neural network optimization
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