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表 2 40 例检出致病基因突变的遗传学分析
Table 2 Genetic analysis of pathogenic gene mutations detected in 40 cases
编号 基因 遗传方式 突变来源 ACMG 等级 突变方式 相关疾病
1 SMN1 AR 父亲 + 母亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr5/7、8 号外显子纯合缺失 脊髓性肌萎缩症
2 SMN1 AR 父亲(x1)—母亲(x1) 1 类 - 致病突变 chr5/7、8 号外显子纯合缺失 脊髓性肌萎缩症
3 SMN1 AR 母亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr5/7、8 号外显子纯合缺失 脊髓性肌萎缩症
4 SMN1 AR 父亲 + 母亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr5/7、8 号外显子纯合缺失 脊髓性肌萎缩症
5 COL6A2 AR/AD 父亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr21:47552017/c.2611G>A(p.D871N) Bethlem 综合征 1 型
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6 COL6A2 AR/AD 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr21:47545383/c.1821T>A(p.C607 ) Bethlem 综合征 1 型
Bethlem 综合征 1 型 / 先天性肌硬化 /Ullrich 先天性
7 COL6A2 AR/AD 父亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr21:47552017/c.2611G>A(p.D871N)
肌营养不良 1 型
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8 CSPP1 AR 父亲 + 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr8:68074049/c.2527_2528delAT(p.M843Efs 25) Joubert 综合征 21 型
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9 CSPP1 AR 父亲 + 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr8:68074049/c.2527_2528delAT(p.M843Efs 25) Joubert 综合征 21 型
10 MECP2 XL 新发 1 类 - 致病突变 chrX:153296363/c.952C>T(p.R318C) Rett 综合征
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11 FOXG1 AD 新发 1 类 - 致病突变 chr14:29236986/c.506del(p.G169Afs 23) 先天性变异型 Rett 综合征
12 G6PD XL 母亲(杂合) 1 类 - 致病突变 c.487G>A(p.G163S) G6PD 缺乏症
Merosin 缺乏或部分缺乏型先天性肌营养不良 / 肢带
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13 LAMA2 AR 父亲(杂合) 1 类 - 致病突变 chr6:129785589/c.7147C>T(p.R2383 )
型肌营养不良 23 型
14 GNB1 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr1:1737957/c.224A>G(p.Q75R) 精神发育迟缓 42 型
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15 SHANK3 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr22:51159010/c.2797del(p.R933Dfs 39) Phelan-McDermid 综合征
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16 CHKB AR 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 c.865dupA(p.T289Nfs 36) 先天性肌营养不良 Megaconial 型
17 KIAA0195 AR 父亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr17:73494529/c.3643G>A(p.D1215N) 智力发育障碍伴心脏缺陷和面部畸形
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18 SPR AR/AD 父亲 + 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr2:73118535/c.655C>T(p.R219 ) 墨蝶呤还原酶缺乏型多巴反应性肌张力障碍
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19 COL1A1 AD 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 c.3134dupC(p.G1046Wfs 20) 成骨不全合并 Ehlers-Danlos 综合征 1 型
20 COL12A1 AD 父亲(杂合) 1 类 - 致病突变 c.4957+1G>A Bethlem 综合征 2 型
21 MCM3AP AR 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 c.5262A>C(p.R1754S) 周围神经病变可伴智力发育受损
发育性和癫痫性脑病 17 型 / 神经发育异常伴不自主
22 GNAO1 AD 新发 1 类 - 致病突变 chr16:56370675/c.626G>A(p.R209H)
运动
23 SMARCA4 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr19:11132545/c.2761C>T(p.L921F) Coffin-Siris 综合征 4 型
24 SYT1 AD 新发 1 类 - 致病突变 chr12:79842738/c.1103T>C(p.I368T) 贝克 - 戈登综合征
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25 CTCF AD 新发 2 类 - 可能致病 chr16:67645347/c.615_618delGAAA(p.K206Pfs 15) 精神发育迟缓 21 型
颅面 - 耳聋 - 手综合征 /Waardenburg 综合征 1 型 /
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26 PAX3 AD/AR 新发 1 类 - 致病突变 chr2:223086101/c.798G>A(p.W266 )
Waardenburg 综合征 3 型
27 CSNK2A1 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr20:472969/c.548_550del(p.H183del) Okur-Chung 神经发育综合征
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28 TRIP12 AD 新发 1 类 - 致病突变 chr2:230650527/c.4814_4815del(p.V1605Dfs 16) 智力障碍 49 型
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29 PUF60 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr8:144899885/c.882_885del(p.Q295Tfs 63) Verheij 综合征
Rubinstein-Taybi 综合征 2 型—Menke-Hennekam 综
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30 EP300 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr22:41573960/c.6245del(p.A2082Vfs 52)
合征2型
31 CNOT3 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr19:54647786/c.303A>T(p.K101N) 智力发育障碍伴语言迟缓
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32 TCF4 AD 新发 1 类 - 致病突变 chr18:52942977/c.662del(p.H221Lfs 13) Fuchs 角膜内皮营养不良 3 型—Pitt-Hopkins 综合征
33 NR2F1 AD 新发 2 类 - 可能致病 chr5:92921093/c.364T>C(p.C122R) Bosch-Boonstra-Schaaf 视神经萎缩综合征
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34 NFIX AD 新发 1 类 - 致病突变 chr19:13189458/c.988delG(p.D330Tfs 71) Marshall-Smith 综合征 /Sotos 综合征 2 型
35 AFF2 XL 新发 2 类 - 可能致病 c.926T>C(p.I309T) 精神发育迟缓 FRAXE 型
36 NLGN4X XL 母亲(杂合) 1 类 - 致病突变 c.1591G>A(p.A531T) Asperger 综合征易感性 2 型
37 SPEG AR 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr2:220333344/c.3187G>A(p.A1063T) 中央核肌病
38 RPGRIP1 AR 父亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr14:21793098/c.2084A>G(p.Q695R) 视锥视杆细胞营养不良 13 型 /Leber 先天性黑矇 6 型
39 CABP4 AR 母亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr11:67223662/c.370C>T(p.R124C) 先天性非进行性视锥视杆细胞突触异常
40 UGT1A1 AR 父亲(杂合) 2 类 - 可能致病 chr2:234669144/c.211G>A(p.G71R) Crigler-Najjar 综合征Ⅰ型
注:ACMG= 美国医学遗传学与基因组学学会,AR= 常染色体隐性遗传,AD= 常染色体显性遗传,XL=X 染色体连锁遗传,G6PD= 葡萄糖 -6-
磷酸脱氢酶;x1 表示拷贝数为 1