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           Evolution）将其列为关注变异株（variants of interest，           2 Omicron 变异株变异来源
               ［2］
           VOI） ，11月26日进一步归类为关切变异株（variants                        根 据 GISAID 平 台 目 前共 享 的 SARS-CoV-2 数
           of concern，VOC）  ［3］ 。我国内地于 2021 年 12 月 14          据库信息，Omicron 变异株的突变位点数量明显多于
           日报告了 Omicron 变异株感染病例，为天津市入境闭                        近两年流行的所有 SARS-CoV-2 变异株，尤其是病
           环管控人员      ［4］ ；11 月 25 日我国香港地区已有 2 例               毒刺突蛋白突变较多。推测其出现的原因可能有以
           阳性病例被证实感染了 Omicron 变异株，其中 1 例为                      下 3 种：（1）COVID-19 慢性感染者体内的 SARS-
           日前从南非入境我国香港，另 1 例或为在酒店隔离                            CoV-2 经历了较长时间的进化，累积了大量突变，
           期间交叉感染       ［5-6］ 。初步证据表明，与其他 VOC 相                通过偶然机会造成了传播。爱丁堡大学的 Andrew
           比，Omicron 变异株再次感染的风险增加，这对全球                         Rambaut 教授提出，Omicron 变异株最有可能在
           COVID-19 疫情防控提出了新挑战。因此，本文就                          COVID-19 慢性感染者体内进化、突变，而此类慢性
           Omicron 变异株的病原学特征、变异来源、传播特征                         感染者的免疫系统可能因其他疾病或药物作用而受
           及可能的机制、流行现状、疫苗对其保护效果、防                              损 ［13］ 。2021 年 6 月 4 日发表在 medRxiv 平台的病例
           控措施等方面的研究进展进行综述，以期为疫情的                              报告报道了南非 1 例 36 岁艾滋病晚期的女性患者，
           科学防控提供参考。                                           该病例在感染 SARS-CoV-2 216 d 后被治愈，SARS-
           1 Omicron 变异株病原学特征                                  CoV-2 在其体内发生了 32 次突变，其中 13 次突变
               Omicron（B.1.1.529）变异株来自 B.1.1 谱系，和              发生在刺突蛋白上         ［14］ 。本轮疫情的暴发点南非是世
           Alpha（B.1.1.7）属于同一谱系，为 SARS-CoV-2 的                 界上艾滋病毒感染率较高的国家之一，约有 780 万
           进化支系之一。SARS-CoV-2 为带有包膜的圆形或椭                        人感染 HIV 病毒，并且超过 200 万感染者未被发现、
           圆形 β 属冠状病毒，直径 60~140 nm           ［7］ 。基因测序         未经治疗，或因不规律服药使得病情控制不佳                      ［15］ 。
           显示 SARS-CoV-2 的基因组包括两个侧翼非翻译区                        艾滋病患者的免疫系统受到严重抑制，HIV 可导致 T
           （5'-UTR 和 3'-UTR）和一个编码多蛋白的长开放阅                      细胞反应失调，进而导致 B 细胞失调和功能障碍。
           读框（ORF）。第一个 5'-ORF（ORF1a/b）编码形成                     因此，HIV 合并感染可能会改变 COVID-19 的免疫反
           16 种非结构蛋白（nsp1~16），3'-ORF 编码辅助蛋                     应 ［16］ 。（2）某种动物群体感染了 SARS-CoV-2，
           白和结构蛋白。结构蛋白包括刺突蛋白S、包膜蛋白E、                           病毒在动物群体传播过程中发生了适应性进化，突变
           基质蛋白 M 和核衣壳蛋白 N。表面蛋白 S 由 S1 和 S2                    速率高于人类，随后溢出传染到人类。SARS-CoV-2
           亚基组成，可以识别宿主细胞受体〔血管紧张素转                              是一种混杂病毒（promiscuous virus），可以感染啮
           化酶 2（ACE2）〕并与之结合，介导病毒向宿主细                           齿动物、猫、狗、白尾鹿等动物               ［17］ 。有专家认为，
           胞的渗透    ［8-9］ 。                                     SARS-CoV-2 可能隐藏在啮齿动物或其他动物身上，
               目前，研究人员对来自博茨瓦纳的 Omicron 变异                      因此经历了不同的进化压力，选择了新的突变                      ［13］ ，
           株病例进行基因组测序，发现该变异株的刺突蛋白                              然后可能会作为一种不同的病毒重新进入人类                      ［18］ 。
           S 有 30 多种突变，包括 A67V、T95I、Δ211/L212I、                （3）变异株在缺乏监控和基因测序的人群中传播和
           G339D 等突变   ［10-11］ 。该蛋白可识别宿主细胞，并且                  进化，由于监测能力不足，其进化的中间代次病毒未
           是人体免疫反应的主要目标             ［11］ 。受体结合域（RBD）           能被及时发现。德国病毒学家 Christian Drosten 认为，
           是病毒中首先与细胞接触的部分，研究人员在                                该变异株并非是在南非进化的，因为南非一直在进
           Omicron 变异株的 RBD 上共发现了 15 个突变，包括                    行大量的基因测序工作，该变异株是在非洲南部的
           K417N、S477N、T478K、E484A、N501Y、G339D、                一些没有进行基因测序的国家进化的                  ［13］ 。但另外一
           S371L、S373P、S375F、N440K、G446S、Q493R、                些专家认为，世界上很难有足够隔离的地方使得病
           G496S、Q498R 和 Y505H   ［12］ ，远超过今年早些时候               毒进行长期进化而没有传播到其他地方                  ［13］ 。
           迅速传播成为全球主要流行株的 Delta 变异株的 2 个                       3 Omicron 变异株传播特征
           突变。Omicron 变异株的突变与 Delta 和 Alpha 突变                     目前研究发现，相比野生株或其他 VOC，
           株有多处重合，并且与传染性增强和逃避感染阻断抗                             Omicron 变异株有更多突变，很可能产生了比 Delta
           体的能力有关      ［11］ 。大多数疫苗是依靠刺突蛋白来激                    突变株更强的传染性和免疫逃逸能力。2021 年 11 月
           活免疫细胞抵抗 SARS-CoV-2，因此 Omicron 变异株                   底，南非国家传染病研究所确定南非豪登省 Omicron
           可能拥有远超 Delta 变异株的感染能力和传播能力                 ［12］ 。   变异株的基本再生数（R 0 ）高于 2，而在 9 月份流
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