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行的 Delta 变异株的 R 0 值远低于 1,这表明 Omicron 地与 hACE2 结合。在 Delta 变异株上发现的 N440K
变异株有可能比 Delta 变异株传染性更强 [19] 。耶鲁 突变让该变异株更能躲避抗体的攻击,而这可能就是
大学教授 Nicholas A. Christakis 认 为,Omicron 变异 Delta 变异株能在 2021 年 3 月引起大流行的原因 [30] 。
株的传染性大致与 Delta 变异株相似或传染性更强。 S1 和 S2 的裂解使 S 蛋白能够与宿主融合。
Delta 变异株的 R 0 为 6,而 Omicron 变异株的 R 0 可能 SARS-CoV-2 在其尖峰具有独特的 S1/S2 Furin 蛋白
[20]
在 4~8 。美国的在线预测引擎 Metaculus 预测, 酶裂解位点(FCS),该切割位点与 SARS-CoV-2 的
Omicron 的 R 0 为 6.7〔95%CI(5.2,8.4)〕 [21] 。过 传染性和致病性有关 [31] 。S1/S2 Furin 蛋白酶裂解位
去一周,南非累计新增病例 135 803 例,远高于 11 点附近共有 3 个突变(H655Y、N679K、P681H)。
月中旬的每周约 2 000 例 [22] 。根据 COVID-19 病例 H655Y 与 N679K 突变可以提高 Omicron 变异株的免疫
数的增加和基因测序结果,比利时进化生物学家 Tom 逃逸能力,在提高对单克隆抗体的抗性方面起重要作
Wenseleers 估计,同时期 Omicron 变异株的感染人数 用,并且可能调节哺乳动物的 S 蛋白融合和宿主细胞
是 Delta 变异株的 3~6 倍 [19] 。南开大学黄森忠团队 进入 [32] ;P681H 突变使得 Furin 蛋白酶与 S 蛋白的
在假设 Omicron 变异株和 Delta 变异株的平均潜伏期 结合亲和力增强,可能有利于病毒进入宿主细胞 [33] 。
和传染期接近的情况下,以 SEIR 模型〔susceptible(易 除刺突蛋白外,Omicron 变异株的其他蛋白中也
感者)-exposed(潜伏者)-infected(感染者)-removed 存在突变位点。核衣壳蛋白上的 R203K 和 G204R 突
(康复者)〕为模型理论,通过 EpiSIX 程序进行拟合, 变与病毒 RNA 的表达增强和病毒载量增加有关 [27] 。
发现 Omicron 变异株的传染力较 Delta 变异株增加约 WU 等 [34] 的研究发现,R203K/G204R 突变具有高度
37.5%。该团队预测至 2022 年 1 月 1 日,南非新增 适应性,有助于增加特定 SARS-CoV-2 突变株的传
确诊规模将达 5.1 万 ~7.2 万人 [23] 。以色列卫生部也 播性和毒力。
发布新闻,认为 Omicron 变异株的传染性比 Delta 高 综上所述,Omicron 变体携带多种突变,这些突
约 30% [24] 。PULLIAM 等 [25] 研究发现,基于当地有 变可能与病毒传染性的增强、中和抗体结合能力的
限的流行病学监测数据,Omicron 变异株没有增加初 下降,以及病毒 RNA 表达增加有关。
次感染的风险,但免疫逃逸能力增强了。Omicron 再 5 Omicron 变异株的流行现状
感染与原发感染的风险比为2.39〔95%CI(1.88,3.11)〕, 南非是第一个检测到 Omicron 变异株的国家,
是 Beta 和 Delta 变异株的 3 倍,反映了 Omicron 变异 2021 年 11 月 8 日分离出第一个样本时,南非每日新
株在造成重复感染方面的能力可能更强。 增病例为 266 例,而在 12 月 2 日达到了 5 092 例。
4 Omicron 变异株基因组特征及风险评估 检测结果阳性率从 11 月 30 日的 10.3% 上升到 12 月
2021 年 11 月 27 日,来自意大利罗马耶稣儿童 3 日的 24.3% [35] 。作为本轮疫情的暴发中心,豪登
医院的多模式医学研究室公布了全球首张 Omicron 变 省在 11 月最后 3 周的测序样本中有 74% 为 Omicron
异株的结构模型图片,Omicron 变异株的突变氨基酸 变异株,这表明 Omicron 变异株正在迅速超越流行的
残基数量为 43 个,远高于 Delta 变异株的 18 个 [26] 。 Delta 变异株,成为南非主导变异株 [35] 。
基础研究发现,Omicron 变异株的传播特点与刺突蛋 2021 年 12 月 7 日,WHO 发布的 COVID-19 每
白 S 多处基因位点突变导致病毒传导能力和膜融合 周流行病学报告显示,过去一周全球新增 COVID-19
能力明显提高有关,尤其是 S1 亚基的多处突变。范 确诊病例超过 410 万例,新增死亡病例超过 5.2 万
航团队发表评述文章,分析了 Omicron 变异株基因组 例,新增死亡病例比前一周增加 10%,非洲区域
特征及风险,认为在 Omicron 变异株的 RBD 区包含 的新增 COVID-19 确诊病例增加 79% [36] 。部分南
15 个氨基酸突变位点,是其他 VOC 的 5 倍以上 [27] 。 非的邻国每周发病率也出现急剧增长,包括斯瓦蒂
其中 K417N、Q493R、N501Y、Y505H 突变可能会增 尼(1 990%)、 津巴 布韦(1 361%)、莫桑 比克
强病毒与 hACE2 的结合能力并增加其感染性 [27] 。 (1 207%)、纳米比亚(681%)和莱索托(219%)。
既往研究发现,具有 N501Y 突变的 S 蛋白对 hACE2 目前,尚不能确定这些新增病例均由 Omicron 变异株
受体的结合亲和力是野生型 S 蛋白的 9 倍 [28] 。此外, 引起。截至 2021 年 12 月 8 日,全球共有 57 个国家
S477N、T478K、E484K 等突变增强了病毒与 hACE2 和地区报告 Omicron 变异株病例。然而,鉴于 Delta
受体的亲和力,并且与免疫逃逸有关 [27,29] 。K417N 变异株在许多国家,尤其是欧洲国家和北美洲国家
突变不直接与 hACE2 相互作用,但其有助于更有效 中占主导地位,因此目前很难判断 Omicron 变异株对