摘要： 目的 通过检测分析2015年杭州市柯萨奇病毒A组16型（CA16）病毒株VP1区核苷酸序列，掌握杭州市CA16的流行情况及种系进化关系，为手足口病的预防和治疗提供支持，同时为CA16疫苗株的选择提供依据。方法 收集2015年杭州市儿童医院256例临床资料齐全且临床诊断为手足口病患儿的粪便或咽拭子，利用反转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增CA16病毒株VP1区核苷酸序列（约1 020 bp），测序后利用DNASTAR和Primer Premier 5.0进行序列比对分析，并用Mega 3.1软件建立检测样本VP1区序列与GenBank上CA16参考毒株VP1核苷酸序列的系统发育树。结果 共分离到80株CA16阳性病毒。序列比对分析结果显示，CA16分离株的核苷酸同源性为90.8%～100.0%，氨基酸同源性为99.5%～100.0%。系统发育树分析结果显示，17株CA16全部属于B1基因亚型，并且同时存在B1a和B1b两个进化分支，其中4株属于B1a亚型，13株属于B1b亚型。结论 2015年杭州市CA16病毒株属于B1基因亚型，与国内外某些地区手足口病病原学及分子进化研究结果一致，有望成为疫苗候选株作进一步研究。
