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·944·  http: //www.chinagp.net   E-mail: zgqkyx@chinagp.net.cn                     March  2023, Vol.26  No.8


                                                                        -3
           损伤刺激反应、单纯疱疹病毒 1 型感染、RNA 代谢、                         P=4.2×10 ) 模 块 呈 正 相 关, 与 deeppink(r=0.50,
                                                                                                         -3
           调节细胞对压力的反应、适应性免疫系统等,TRRUST                          P=0.01)、lavender(r=0.60,P=2.6×10 )、
                                                                                             -3
           数据库预测 MHC Ⅱ反式激活蛋白(CIITA)转录因子可                       lavenderblush3(r=0.56,P=5.9×10 )呈负相关,以
           能参与了 EAT 间 DEGs 的调控,见图 6、7。                         |MM|>0.8 筛选所选模块内 hub 基因,见图 10。
           2.2 EAT 组织的 WGCNA 分析                                2.3 关键基因的获得 将 DEGs 同模块内 hub 基因
           2.2.1 EAT 组织 WGCNA 软阈值的选择与模块的初步划                    取交集,获得差异表达的模块内 hub 基因,将其作为
           分 本研究最终以β=5作为软阈值来构建共表达网络,                           EAT 组织参与 AS 病理生理过程的关键基因,其中上调
           设置每个基因模块中基因数目最小为 30,设定基因的                           hub 基 因 为 DDX47、FEM1C、NOL11、SRP54、ABI1、
           聚类高度上限为 0.995。最终得到 156 个网络模块,模                      PATL1、BNIP2,下调 hub 基因为 C1orf159、CHCHD4,
           块中的基因个数为 30~2 169。根据拓扑重叠程度,制作                       见图 11。
           模块相关性图,见图 8、9。                                      2.4 免疫细胞浸润分析 通过 Cibersort 反卷积算
           2.2.2 临床信息关联与 hub 基因的获取 将各个划分                       法, 计 算 GSE64554 芯 片 中 CAD 组 和 健 康 对 照 组
           出的模块与临床信息进行关联分析,得到与 AS 患者的                          EAT 的免疫细胞浸润情况。研究发现,CAD 组 EAT
                                                                                           +
           EAT 样本临床信息最为相关的模块进行后续研究。结                           组织较健康对照组中初始 CD 4 T 细胞表达丰度升高
           果 发 现,AS 患 者 EAT 与 green4(r=0.50,P=0.02)、           (P=0.048),静息树突细胞表达丰度减低(P=0.044),
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           slateblue(r=0.54,P=8.0×10 )、darkseagreen4(r=0.55,   见图 12、13。
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           P=6.4×10 )、darkolivegreen1(r=0.55,P=7.0×10 )、       2.5 CAD 组与健康对照组 EXO 间 DEGs 采用“limma”
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           sienna4(r=0.56,P=5.6×10 )、brown3(r=0.57,            包选获取 CAD 组与健康对照组 EXO 间 DEGs,以





















                                              图 6 EAT 间 DEGs 的 Metascape 富集分析
                            Figure 6 Metascape enrichment analysis of differentially expressed genes in epicardial adipose tissue

                                                               P<0.05,|logFoldchange|>1 作为筛选差异基因的阈值,
                                                               共得到 DEGs 1 658 个,其中上调 278 个,下调 1 380 个,
                                                               见图 14、15。
                                                               2.6 EAT 来源 EXO 将 CAD 组与健康对照组 EAT、
                                                               EXO 间 DEGs 取 交 集 并 做 Venn 图, 共 获 得 129 个 基
                                                               因,其中上调 16 个,下调 113 个,经筛选,将 BPI、
                                                               BIRC5、CXCL12、RNASE1、F2R 作为关键基因并通过
                                                               qRT-PCR 进行验证,见图 16。
                                                               2.7 EAT 来源 EXO 间 DEGs 的验证 收集 CAD 组和
                                                               健康对照组外周血,运用 qRT-PCR 验证生物信息学分
                                                               析所得的 EAT 来源 EXO 基因 BPI、BIRC5、CXCL12、
                 图 7 EAT 间 DEGs 的 TRRUST 数据库预测转录因子             RNASE1、F2R 的 mRNA 水平。结果显示,与健康对照
           Figure 7 TRRUST database-based analysis of differentially expressed
           genes in epicardial adipose tissue to predict transcription factors  组相比,CAD 患者的 5 个所选基因的表达水平差异有
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