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因的阈值,得到差异表达的 1 511 个 mRNA,其中表达 对合并后 CAD 组较健康对照组 EAT 间 DEGs 进行
上调 956 个,表达下调 555 个,见图 1、2。 GO 富集分析,共获得符合筛选条件的 GO 术语共 800 条,
2.1.2 EAT 间 DEGs 的 GO/KEGG 富集分析与 PPI 网络 其中 BP 567 条,主要涉及细胞压力反应、细胞 DNA 损
伤刺激反应等。获得 CC 127 条,主要涉及细胞质基质、
MHC 蛋白复合物、内质网腔侧的组成部分等。获得 MF
106 条,主要涉及 MHC Ⅱ类蛋白复合物、特殊核糖核
酸酶激活等,见图 3。共富集到 KEGG 通路 20 个,主
要涉及 RNA 降解、病毒性心肌炎、移植物抗宿主病、1
型糖尿病等信号通路,见图 4。
将所获 EAT 间 DEGs 输入 STRING 数据库,构建
PPI 网络,其中实际上有互作关系的节点有 1 507 个,
有 1 258 条边,每个节点的平均 Degree 为 1.67 分。将
PPI 网络图导入 Cytoscape 软件,使用 CytoHubba 插件
根据 MCC 算法得到连接度前 10 的基因并作图,分别
为 RPS27A、PSME4、PSMA1、PSMA5、GLI3、GLI1、
PSME2、PSMB9、SUFU 和 SHH,见图 5。
2.1.3 EAT 间 DEGs 的 Metascape 富集分析 对合并后
图 1 CAD 组与健康对照组 EAT 间 DEGs 火山图
Figure 1 Volcano plot of differentially expressed genes in epicardial CAD 组与健康对照组 EAT 间 DEGs 进行 Metascape 富集
adipose tissue between CAD group and healthy control group 分析,发现 DEGs 主要富集于嗅觉转导、细胞对 DNA
注:CAD= 冠状动脉粥样硬化性心脏病
图 2 CAD 组与健康对照组 EAT 间 DEGs 热图
Figure 2 Heatmap of differentially expressed genes in epicardial adipose tissue between CAD group and healthy control group